我國科研團隊建成“數字家蠶”共享分析平臺
發布時間：2023/11/15 9:36:03編輯：Ma Liang
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從西南大學資源昆蟲高效養殖與利用全國重點實驗室獲悉，實驗室代方銀教授團隊取得最新科研成果——“數字家蠶”共享分析平臺，對于推動家蠶泛基因組成果在功能基因組、基因組選擇和分子設計育種等方面的研究應用具有重要意義。相關研究成果近日在國際學術期刊《核酸研究》在線發表。
在現代蠶學研究和育種實踐中，泛基因組序列和多組學數據已經成為科學家手中不可或缺的基礎資源，可以縮短研究和育種的時間，顯著提高工作效率。然而，多組學大數據的整合分析和使用具有成本高、技術難度大的特點。
代方銀介紹，分析平臺不僅涵蓋家蠶基因序列信息，還整合了家蠶基因表達、調控、功能研究等數據，提供了開展比較基因組和功能基因組等方面研究的分析工具。
“數字家蠶”共享分析平臺數據和功能示意圖。（受訪者供圖）
這是繼2022年該團隊發布家蠶超級泛基因組圖譜后，推動創建“數字家蠶”取得的又一重大進展。分析平臺整合了家蠶泛基因組序列及多組學數據，將一個具有上千個種質資源的線下實體基因資源庫轉化為組學序列數據庫并搬上互聯網，實現種質資源基因組、遺傳變異及表型等數據的開放共享和可視化分析。
“我們將它比喻為一部智能、高效的家蠶基因‘數字字典’或超級‘圖書館’，研究人員能在這里快速獲取家蠶基因組相關信息。”西南大學資源昆蟲高效養殖與利用全國重點實驗室博士后陸昆鵬說。
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